¿Está bien cambiar el medio mientras chateas con una chica?

En primer lugar, ambos logran el mismo objetivo: comunicación efectiva. Mientras se cumpla ese objetivo, no debería haber ningún problema en cuanto a que use WhatsApp o Facebook Messenger o cualquier otra cosa.

Siempre y cuando cualquier aplicación te permita comunicarte de manera efectiva, no veo ningún problema en pedirle a alguien de cualquier género que cambie de aplicación. Así que, adelante, cambia sin mucho, y disfruta chateando!